Habe davon nicht viel Ahnung, aber in der Regel sind es zwei Leitungen, manchmal auch drei. Dann müssen beide Geräte das selbe Protokoll (NMEA, SiRF, ...) verwenden. Sieh doch mal nach, wie die Daten abgespeichert werden (*.NMEA, *.DAT).
http://www.pocketnavigation.de/2006/05/protokoll-nmeasirf/
Nachtrag: Das AVI enthält einen Textstream. Darin könnten die GPS-Daten gespeichert sein.